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2022年12月29日 星期四

[實證] 文獻搜尋自動化利器 Rayyan教學介紹

 


不管是統合分析、系統性回顧或者要在一堆文獻中尋找符合自己設定條件的研究,文獻搜尋是必經的過程,過去常用的方式包括透過pubmed、Embase、Cochrane等資料庫搜尋後,將文獻摘要或檔案導入endnote進行管理,如果文獻數量很多,往往需要花費大量時間進行閱讀與篩檢,其實多一個Rayyan的自動化步驟可以節省不少文獻篩選的時間。


Rayyan是大約2015年推出的線上文獻管理平台,透過網頁操作就可以執行,不需要下載軟體,操作方法便利。


先在官方網站註冊,分為免費版、學生版、專業版跟團隊版本,有不同的收費標準跟功能,建議新手試用者先使用免費版本,就可以使用基本但不錯的功能。他提供標籤、關鍵字以及自動化分類等功能,幫助團隊整理並篩檢相關的文章。




基本介紹


登入帳戶後進入控制面板,有四個主要分類,大部分的人使用前兩個分類

  • My review 我的系統評價:自己進行的研究
  • Collaboration Review 合作的系統評價:與別人合作的研究
  • Translation Only Reviews 翻譯的系統評價
  • Other Reviews 其他系統評價



可以在My Review選擇new view,輸入相關資料後創立一個專案,進入後會有幾個功能鍵

  • Show:選擇這個專案,進行處理
  • Invite:邀請別人加入這個專案
  • Archive:封存這個已完成的專案
  • Delete:刪除



匯入檔案


Rayyan支援的資料格式很多,包括大家常用的pubmed、Embase以及endnote等都有

  • EndNote Export
  • Refman/RIS 
  • BibTeX 
  • CSV 
  • PubMed XML 
  • New PubMed Format
  • Web of Science/CIW


功能介紹


匯入後可以進入主要介面,跟endnote有點類似但是多了不少自動化分類功能

在左邊的欄位是已經分類篩選好的

右邊上面是文章列表,點選文章後,在右邊下面是文章摘要





左邊欄位依序有

Inclusion decision:可以根據閱讀後決定是否納入(從undecided到included、maybe、excluded)

Search method:目前匯入的檔案

Keyword for include:這邊列出的關鍵字,會在文章摘要中以綠色字標註,可以利用顏色快速決定這邊文章的重要性,可以自行增減

Keyword for exclude:這邊列出的關鍵字,會在文章摘要中以紅色字標註,可以利用顏色快速決定是否排除,可以自行增減,keyword的顏色能在右下角欄位中看到,能夠用highlight的功能開啟

Label:自行利用標籤標註文獻




Duplicated:移除重複文獻

Exclusion reasons:篩檢文獻時紀錄排除的原因

Topics:Rayyan系統產生的主題關鍵字

Location:文獻主要國家分類



Language:文獻主要語言

Publication types:研究設計類型

Journal:文獻主要刊登期刊




如果是多人進行文獻篩選,可以透過平台的過濾器來評估每個作者對於文獻是否納入的判斷,平台提供作者盲性篩選的方式,可以看到在盲性狀況下兩位作者篩選文獻是否一致或矛盾


最後可以透過將納入的文獻導出,可以在endnote等管理軟體進行後續整理


使用心得


透過Rayyan的功能可以快速篩檢摘要,對於文獻搜尋的步驟可以加快,部分功能有點像之前介紹過的小工具multi-highlight,另外提供多人篩選的方式,有矛盾時再進行第三人判斷,對於團隊分工是不錯的方式。


Rayyan也有一些需克服的問題,個人覺得最重要的是需網路才能使用,雖然目前網路方便,包括wifi、手機等,但仍有少數無網路的狀況,而Rayyan中全文只能透過上傳pdf方式來閱讀、也無法像endnote一樣使用全文尋找下載的功能。整體來說,免費版的Rayyan是一個不錯的自動化篩選工具,對於文獻搜尋步驟有一定程度的優化,值得推薦使用。

p.s 個人無使用付費版本的經驗,對軟體公司也無利益關係



延伸閱讀

如何有效的文獻搜尋 小工具 multi-highlight 簡介


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