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2021年4月12日 星期一

[實證] 圖表萃取數據工具WebPlotDigitizer介紹

 


這次台灣實證醫學學會的系統性文獻與統合分析工作坊的課程,看到新版Cochrane handbook有介紹這系列工具,其中包括WebPlotDigitizer、Plot digitizer、Engauge digitizer、GetData Graph Digitizer等有類似功能。


這個WebPlotDigitizer有網路平台直接操作,也有下載的免安裝版本,還適用於mac與windows電腦,相對於其他軟體容易卡關的安裝因素:僅支援windows系統、安裝步驟複雜、要有java支援、台灣的mac不能安裝美國地區軟體等因素,這個WebPlotDigitizer 相對方便親民。


軟體網站 

網路平台(簡中版)  

網路平台(英文版)  

下載位置 


這個軟體可以對數據視覺化的圖片進行逆向工程,來提取研究中沒提到的數值,可以應用的圖形廣泛,包括各種圖表(XY,長條圖,極地圖,三元圖,地圖等...)

過程不算複雜,熟悉之後幾分鐘之內就可以輕鬆提取大量數據點,重點是免費使用,開源和跨平台。

網頁:目前有支援英文、簡中、德語與法語版本。
免安裝版本:英文顯示

個人建議先用網頁版操作,了解各個操作的意義,之後再考慮用免安裝版本處理


萃取步驟基本設定


上傳圖檔,選擇合適的圖型類型
依照順序設定參考的X與Y軸:X1, X2, Y1, Y2
填寫X1, X2, Y1, Y2的數據,建立尺標比例
按下完成,並填寫XY軸數據






數據提取準備


先用自動提取的方式建立取點的範圍(個人常用方塊、也再考慮畫筆)


點選設定要取線的顏色(前景色),用顏色過濾,找出曲線




設定XY軸取值距離的算法:Px,可以選平均窗口(最常用),主要是通過計算
位於ΔX像素的區域內顏色的平均位置,如果在粗線的圖中偵測到太多點就要把數值調高,如果在線條中每個點距離太大,可考慮調低
最後選運行



建立與確認數據


按運行鍵,建立數據資料,可用手動輔助,刪除不必要或錯誤的點,按畫面左側的查看數據,顯示數據欄位
數據格式選擇,可以減少小數點位數至2位數,選擇固定呈現
根據已知資訊,例如自己設定或已知的資料再去確認提取數據




小結


個人有用一些圖表跟excel做過驗算,雖然不是100%正確,但還是有一定準確度,WebPlotdigitizer是個相對簡單的工具,有其他功能需求者,歡迎自行找他的工作手冊查閱,希望對需要數據卻被圖表卡住的實證朋友有幫助

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